قامت وزارة الأوقاف على مدار الثلاث سنوات الماضية باعتماد 282 منحة ماجستير مجانية بالمعهد العالي للدراسات الإسلامية، وذلك للأئمة والإداريين المتميزين شاملة الدراسة والكتب للحصول على درجة الماجستير، وذلك بواقع 100 منحة دراسية خلال العام الدراسي 2017 – 2018، وعدد 118 منحة دراسية خلال العام الدراسي 2018 – 2019، وعدد 64 منحة دراسية خلال العام الدراسي 2019 – 2020. وتأتي هذه المنح الدراسية تشجيعًا من الوزارة على مواصلة البحث العلمي والتعليم المستمر، للمتميزين دعويًّا وإداريًّا من الذين اجتازوا اختبارات التميز بالوزارة مثل: الإيفاد أو الإدارة الإشرافية ، أوالمرافقين لبعثة الحج، أو القراءة الحرة، أو إمام المسجد الجامع، أو الأئمة الجدد، أو المسابقة الثقافية الكبرى، أو إمام منطقة، أو من الملتحقين بالأكاديمية الوطنية للتدريب، وأكاديمية الأوقاف الدولية لتدريب الأئمة والواعظات وإعداد المدربين أو الأئمة المجتهدين في أداء مهامهم. هذا وقد اهتمت الوزارة بالأئمة المغتربين وأئمة المناطق الحدودية والنائية، فجعلت لهم نصيبًا خاصًا من هذه المنح خلال العامين الماضيين، كما خصصت لهم النصيب الأوفر خلال العام الحالي .