تعانى بعض القرى المطلة على ترعة النوبارية من تلوث شديد فى المياه، خاصة فى ترعة الرى فرع حارس 2 ,3 والتى تمر بكتلة سكنية بقرى طيبة 2، حيث تختلط مياه الترعة بمياه الصرف الصحى والقمامة والسباخ، مما يؤدى إلى تلوث مياه الشرب ونفوق الأسماك. من جانبه أشار سعيد ضيف الله رئيس لجنة الشكاوى والمقترحات بالمجلس المحلى لمدينة الإسكندرية إلى أن ترعة الرى فرع حارس تمر وسط كتلة سكنية مكتظة بالسكان بطول ا كم، حيث يقوم الأهالى بإلقاء القمامة والسباخ ومياه الصرف الصحى بالترعة، مما يسبب التلوث الخطير وانسداد المجرى المائى وعدم وصول المياه إلى الأرض الزراعية، وذلك نتيجة لعدم وجود شبكة صرف صحى وعدم وجود خدمة لنقل القمامة بهذه الكتلة السكنية التى تزيد عن 70 ألف نسمة ويقوم الرى بتطهير الترعة بصفة دورية، ولكن المخلفات تلقى على الطريق الأسفلت، مما يؤدى إلى تلفه وتهالكه.