قال الدكتور محمد مرسى، رئيس حزب الحرية والعدالة، إن المهندس خيرت الشاطر لن يتلقى أوامره من الدكتور محمد بديع المرشد العام لجماعة الإخوان المسلمين، إذا ما فاز فى انتخابات رئاسة الجمهورية، مؤكداً أن تخوفات الناس من سيطرة الجماعة على السلطة بعد وصول "الشاطر" للرئاسة واهية ولا أساس لها. وأضاف مرسى، فى حواره مع الإعلامى عمرو الليثى ببرنامج 90 دقيقة، الذى يذاع على قناة المحور قائلاً: "هذا مستحيل، مجلس شورى الجماعة لن يصدر قراراً للرئيس تماماً، كما يفعل مع حزب الحرية والعدالة، فنحن لا نتلقى أوامرنا منه وكذلك لن يفعل رئيس جمهورية مصر". ولفت رئيس حزب الحرية والعدالة إلى أن انتماءه والشاطر وكل الإخوان لمصر أولاً، وهذا لا يتنافى مع مصلحة الجماعة. وأوضح مرسى، أن استقالة "الشاطر" من الجماعة والحزب تؤهله للوصول لمنصب الرئاسة وتبعد عنه شكوك سيطرة مجلس شورى الإخوان عليه، لافتاً إلى أن "الشاطر" سينظر بكل احترام وتقدير للمرشد العام لو وصل للرئاسة، وأن الجماعة ستسعى لتطبيق النظام البرلمانى بعد المرحلة الانتقالية سواء جاء نائب المرشد العام الأسبق رئيساً لمصر أو لا.