الشاي الأخضر يعتبر بوجه عام آمناً وله العديد من الفوائد الصحية، ولكن له بعض الآثار الجانبية الخطيرة. يقول الدكتور أحمد منصور أستاذ الطب البديل والتداوي بالأعشاب: إن شرب كميات كبيرة من الشاي الأخضر يسبب الكثير من المشاكل الغذائية بسبب ما يحتويه من الكافيين الذي يعمل كمنشط، فالمصابون بضربات القلب غير المنتظمة يجب أن يمتنعوا عن شرب الشاي الأخضر وكذلك النساء الحوامل والمرضعات وينصح بعدم تناوله إلا بعد مرور ساعتين من تناول الوجبة الغذائية؛ لأن شربه بعد الأكل مباشرة يعوق امتصاص الجسم للحديد ومع الوقت قد يسبب الأنيميا، كما أن وجود حمض التانيك وخصوصاً بالشاي المغلي يقلل امتصاص البروتينات في الطعام وكذلك عند غلي الشاي بكثرة ينتج مواد ضارة جداً (بيروكسيدات) تضر الكبد والكليتين والأغشية المخاطية للقناة الهضمية كما أن شرب الشاي المثلج والمغلي يضران مريض النقرس ومن لديهم أملاح كثيرة بالبول.