تعاني المناطق الصناعية الأربعة في محافظة سوهاج والتي يطلق عليها "مدنا" من الإهمال وتوقف الإنشاءات بها رغم أنها كانت لبنة مهمة لتنمية الصعيد، والتي تم إنشاؤها بحي الكوثر والمنطقة الصناعية بغرب جرجا، والمنطقة الصناعية بغرب طهطا، والمنطقة الصناعية باحيوة بأخميم. وتشمل المنطقة الصناعية في الكوثر العديد من المصانع الكبرى، وتعتبر مصانع "المعكرونة" أكبرها، وكان من المقرر أن يكون هناك مصانع أخرى تم التخطيط لإنشائها إلا أن أحداث ثورة 25 يناير عطلت عملية الإنشاء، كما توقفت بعض المصانع التي كانت في بدايتها جديدة. وتقع المنطقة الصناعية بالكوثر شرق النيل في بداية طريق الصعيد- البحر الأحمر، وعلى طريق القاهرةأسوان الشرقي، ومساحتها 500 فدان ومقسمة إلى ثلاثة مراحل. أما المنطقة الثانية فهي غرب جرجا ويمر بها طريق القاهرةأسوان الصحراوي الغربي، وتقع جنوب مطار سوهاج وجامعة سوهاج، وتقام على مساحة 1086 فدانًا مقسمة على خمس مراحل، ومن أهم الصناعات التي تقع فيها مصنع جرجا لقصب السكر، ومصانع أخرى تغذي الصعيد بالكامل وليس سوهاج فقط. أما المنطقة الثالثة التي تقع بغرب طهطا شمال غرب مدينة سوهاج بمسافة 50 كم، فإنها قريبة من الطريق الصحراوي الغربي، وتقع على مساحة 912 فدنا، ومقسمة إلى أربع مراحل، وأغلب المصانع هناك، لصناعة القطن والإسفنج. وكان قد سبق وحدث حريق منذ 3 أشهر هناك والتهم مصنعا للقطن، وامتد إلى بعض غرفه، بسبب عقب سيجارة، ومنذ ذلك الوقت بدأت الإجراءات المشددة للحفاظ على المصانع وعدم تكرر الواقعة. أما المنطقة الصناعية ب"الأحايوة" شرق مركز أخميم، فإنها تقع شرق النيل على طريق القاهرة- أسوان الشرقي، وتبعد 6 كم عن النهر طريق سوهاج / البحر الأحمر، وتبعد 25 كم عن مدينة سوهاج - السكة الحديد – طريق القاهرةأسوان الزراعي الغربي، وتقع على مساحة 250 فدانا، منها 159 فدانا للنشاط الصناعي و91 فدانا طرق وخدمات، وتوجد هناك مشروعات استثمارية متنوعة، ومن المقرر أن تبدأ مشروعات أخرى في إطار البرنامج الاقتصادي ومع السنة المالية.