خلال مشاركة الأهلي في مونديال الأندية حصد الكثير من الألقاب منذ أول مشاركة في مونديال 2005 حتي البطولة الأخيرة 2012. احتل نادي القرن عام 2005 باليابان المركز السادس والأخير في البطولة تحت قيادة البرتغالي مانويل جوزية ولم يتمكن إلا من أحراز هدف واحد أمام فريق سيدني الاسترالي بقدم عماد متعب في المباراة الأفتتاحية التي خسر فيها الأهلي 1/2، وخسر أيضاً المباراة الثانية له أمام فريق أتحاد جده السعودي 0/1، وحصل الأهلي علي مليون دولار نتيجه الحلول في المركز السادس، وحينها كان الأهلي يصنف الأول علي الأنديه الأفريقية. وفي النسخه التالية من عام 2006 باليابان بقيادة مانويل جوزية عاد الأهلي بقوة وأحتل المركز الثالث وسط الكبار، وفاز في مباراته الأفتتاحيه 2/0 علي أوكلاند سيتي النيوزيلاندي وأحرز الهدفين "الانجولي امادو فلافيو ومحمد أبوتريكة" وخسر المباراة الثانية أمام أنتركونتينينتال 1/2 وأحرز الهدف "فلافيو" وفاز في مباراة تحديد المركز الثالث علي كلوب أميريكا2/1 وأحرز الهدفين "أبوتريكة"، وحصل الأهلي علي 2.5 مليون دولار مكافئه علي المركز الثالث. و توج محمد أبوتريكة بلقب هدافي البطولة بعد أحرازة 3أهداف "هدف في أوكلاند سيتي وهدفان في كلوب أميريكا". ولم يتمكن الأهلي من الوصول لبطولة 2007 ولكنه عاد في 2008 في اليابان تحت قيادة مانويل جوزية ليحتل المركز السادس قبل الاخير بعد خسارة من باتشوكا البرازيلي 2/4 وأحرز الهدفين "فلافيو والبرازيلي بينتو"، وحصل الأهلي علي مليون دولار نتيجه الحلول في المركز السادس. وغاب الاهلي ثلاث سنوات حتي عاد في 2012 باليابان تحت قيادة حسام البدري الذي أستطاع أن يحرز لقب أبطال افريقيا رغم الصعوبات من توقف الدوري أو الأزمة المالية وبتأهلة للمونديال بات الأهلي من أكثر الأندية تأهل للبطولة أربع مرات بالتساوي مع أوكلاند سيتي. ولكن لم يستطع الأهلي أن يتفوق علي ما قدمه في 2006 و أكتفي بالحلول في المركز الرابع، وفاز الأهلي في المباراة الأفتتاحيه 2/1 أمام فريق هيروشيما الياباني وأحرز الهدف الأول السيد حمدي وأخر بقدم أبو تريكة، وخسر المباراة الثانية أمام كورنثيانز 0/1 ليخسر فرصة التأهل للدور النهائي، فلعب علي المركز الثالث والرابع أمام مونتيري المكسيكي وخسر 0/1، ليحتل المركز الرابع ويحصل علي 2مليون دولار مكافئة له. وكان أبرز اللاعبين الذين شاركو الأهلي مشوارة في المونديال محمد أبو تريكة وقلب الدفاع وائل جمعه والمهاجم العتيد عماد متعب، ومن غير المصريين الأنجولي فلافيو الذي شارك الأهلي في ثلاث بطولات قبل رحيلة في عام 2009. ويعتبر الأهلي أكثر الفرق المشاركة في البطولة عالميا بمجموع 9 مباريات والتأهل أربع مرات ويتساوى أبو تريكة يتساوي مع ليونيل ميسي نجم برشلونة والبرازيلي دينيلسون بأربع أهداف علي لقب هدافي البطولة منذ أول نسخه لها في عام 2000.