بعثت الكنيسة القبطية الكاثوليكية ببرقية تهنئة للدكتور محمد مرسي، بمناسبه فوزه برئاسة الجمهورية. وقالت الكنيسة في برقيتها: "تتقدم الكنيسة القبطية الكاثوليكية في أرض مصر وبلاد المهجر بالتهنئة لسيادتكم؛ لفوزكم بثقة الشعب المصري في الانتخابات الرئاسية، التي جرت في الأيام القليلة المنصرمة، بمعونة العلي القدير وبحكمتكم، إنكم قادرون على إدارة دفة البلاد، ومراعاة المصالح العليا للوطن ولكل أبنائه، لكي يظل نسيجه متلاحما كما كان على الدوام، وقد شعرنا في خطاباتكم الأخيرة باستعدادكم لإجراء المصالحة الوطنية الشاملة، والتعاون مع كفاءات وقيادات كافة الفصائل والأطياف، التي تشكل نسيج الوطن، من أجل تحقيق الخير العام."
وأضافت الكنيسة: "نصلي لكي يوفقكم الرب إلى ما فيه خير البلاد، واستكمال مؤسساتها اللازمة لتحقيق دولة مدنية ديمقراطية حديثة، ونتمنى أن ينسى جميع المصريين خلافاتهم، من أي نوع كانت، وأن يتصالحوا ويتكاتفوا الآن للعمل المشترك بقلب واحد، حمى الرب مصر وكل أبنائها من كل شر."