قالت مصادر ان السبب الرئيسي في حرق مقر قناة الجزيرة مباشر مصر هو اغتيال القيادي في حركة حماس ورئيس أركانها احمد الجعبري والذي أرجعت مصادر في حركة حماس ان طريقة اغتياله جاءت بعد لقاء غسان بن جدو المذيع بالقناة بالشهيد احمد الجعبري وقيام أدارة القناة بتسليم الشريط إلى إسرائيل حسبما صرح بن جدو بعد لقاء الجعبري وأدلى به وقال ان " الجزيرة أعطت شريط اللقاء إلى إسرائيل وهو ما تسبب في اغتيال الجعبري . وقالت مصادر ان المتورطون في إحراق قناة الجزيرة بمصر شباب محسوبون على تيار ديني دبروا حادث الحرق ردا على اغتيال المجاهد الشهيد احمد الجعبري .