صرح مصدر بوزارة الداخلية من المكلفين بتأمين الصلاة، بأن عدد الجنود لتأمين الصلاة نحو 5000 جندي أمن مركزي، وأفراد أمن سريين لتأمين المسجد والساحات المحيطة به. كما مر موكب د.محمد مرسي عبر ممر خاص محاطًا بقوات الحرس الجمهورى والحراسات الخاصة كما دخل رئيس الجمهورية إلى المسجد وكبار رجال الدولة عبر خيمة أقيمت خصيصًا ببوابات إلكترونية للكشف عن المتفجرات.
كما أدى الصلاة مع الرئيس مرسي الدكتور هشام قنديل، رئيس مجلس الوزراء، والفريق أول عبد الفتاح السيسى، وزير الدفاع، واللواء أحمد جمال الدين، وزير الداخلية، والدكتور طلعت عفيفي، وزير الأوقاف، والدكتور ياسر على، المتحدث الرسمي لرئاسة الجمهورية.