أكد الدكتور عبدالقوي خليفة وزير المرافق ومياه الشرب أن تكلفة تشغيل وصيانة مياه الشرب تقدر ب 4.8 مليار جنيه سنوياً لتنقية مياه الشرب من نهر النيل حتي أطراف الشبكات. قال اللواء سيد نصر رئيس الشركة القابضة لمياه الشرب والصرف الصحي: إن عملية تطهير مآخذ محطات المياه داخل نهر النيل كانت تقوم بها وزارة الري حتي تولي الدكتور محمود أبو زيد للوزارة والذي أصدر قراراً بأن تقوم شركات المياه بالتطهير حول مآخذ محطاتها داخل مجري النيل مما أدي إلي ارتفاع تكاليف التشغيل والصيانة ومثَّل عبئاً علي الشركات حيث تقوم بالتعاقد مع بعض شركات المقاولات المتخصصة في عملية نزع الطمي.. مشيراً إلي أن تكلفة تطهير المأخذ الواحد تتراوح ما بين 300 و450 ألف جنيه في المرة الواحدة وتختلف التكلفة حسب حجم المآخذ وحسب عدد مرات التطهير لأن هناك بعض المآخذ يتم تطهيرها مرة وثلاث في السنة .