أكد مجلس النقابة العامة للأطباء أن الادعاء بفصل الأطباء غير المشاركين في الإضراب من النقابة غير صحيح بالمرة، كما أن الجمعية العمومية غير العادية فى 21 سبتمبر 2012 لم تخرج بمثل هذا القرار، وأهابت النقابة العامة بجميع الأطباء الذي ينقلون مثل هذه الأخبار تحرى الحقيقة والصدق والموضوعية. وحول د. شهاب إبراهيم، نقيب أطباء بني سويف، مديري بعض المستشفيات الذين قاموا بتهديد الأطباء وإرغامهم على العمل أثناء الإضراب الذي أقرته الجمعية العمومية إلى التحقيق معهم في النقابة العامة للأطباء. وحول للتحقيق كلا من مدير مستشفى سمسطا المركزي، ونائب المدير ومدير مستشفى أهناسيا بدعوى تهديدهم للأطباء، وإجبارهم على قطع تذاكر بالعيادات الخارجية بالمستشفى، معتبرا ذلك تعديا لقرارات الجمعية العمومية للأطباء، مشيرا إلى أنه قام بتحذيرهم كتابة من خلال مجلس نقابة بني سويف، ولجنة متابعة الإضراب بالنقابة الفرعية. كما حول نقيب بني سويف أربعة أطباء من مستشفى بني سويف العام للتحقيق، لعدم دخولهم في الإضراب وقيامهم بقطع تذاكر بالعيادات الخارجية بالمستشفى للمرضى وممارسة عملهم. من ناحية أخرى، طالبت مستشفى "أم الأطباء" النقابة العامة للأطباء بتزويدها بأمن كاف للمستشفى لحماية الأطباء والعاملين بالمستشفى وحماية المنشأة، وإلا سيكون من الصعب عليهم الاستمرار في الإضراب.