نفى الأزهر نفيا قاطعا الأخبار حول تدخله في تعيين بعض الوزراء الجدد في تشكيل حكومة د. هشام قنديل، وخاصة وزير الأوقاف. وقال بيان للأزهر: "إن شيخ الأزهر الشريف، د. أحمد الطيب، يقدر قواعد الديمقراطية والتداول على السلطة، وبالتالي، فإنه على ثقة من أن رئيس الوزراء سيختار وزيرا للأوقاف من المرشحين، ممن تتوافر فيهم شروط الحكمة والكفاءة والحفاظ على عقيدة الأمة والنهوض بقطاع الأوقاف". وطالب الأزهر الشريف جميع وسائل الإعلام بتحري الدقة في تناول أخبار الأزهر وشيخه، كما طالب الجميع بعدم الزج بمؤسسة الأزهر في الصراعات الفكرية والسياسية التي تموج بها الساحة.