نعى الرئيس محمد مرسي، الضحايا الذين لقوا حتفهم في حادث قطار أسيوط، وقال: "تابعت وبكل الآسي والحزن منذ الصباح الباكر ما وقع صباح اليوم من حادث اليم". وأضاف في تغريدة له عبر حسابه الخاص بموقع التدوينات القصيرة "تويتر"، "بالأصالة عن نفسي وبالنيابة عن الشعب المصري كله أتقدم بخالص العزاء والمواساة لأسر وأبناء الضحايا والمصابين في هذا الحادث الأليم". وأعلن الآتي: قبول استقالة وزير النقل ورئيس هيئة السكة الحديد، تحويل المسئولين إلى النيابة العامة للتحقيق وسرعة الانجاز في التحقيقات لمعرفة المتسبب في هذا الحادث الأليم، اتخاذ كافة الاجراءات من جميع الجهات التنفيذية المعنية لتعويض أسر الضحايا والمصابين وتذليل كافة العقبات لهم.