رصد التحالف المصري لمراقبة الانتخابات الرئاسية عددا من التجاوزات خلال سير العملية الانتخابية، تمثلت في منع المتابعين ووكلاء المرشحين من دخول اللجان، ووجود الدعاية الانتخابية للمرشحيّن، فضلا عن وجود حالات لما أسمته بالعنف والبلطجة. فيما يتعلق بمنع المراقبين من دخول لجان الانتخابات، أشار التحالف المصري، في تقريره الثاني، قيام جبهة "مصر بلدي" بمحافظة الدقهلية بإصدار كرنيهات للناخبين تشبه كرنيهات المتابعة الصادرة من اللجنة العليا للانتخابات، وسمح رؤساء اللجان لهم بالدخول لمتابعة الانتخابات، وترتب على ذلك منع المتابعين الرسميين والحاملين لتصاريح متابعة الانتخابات من الحضور بحجة وجود متابعين أخرين غير تابعين لمنظمات المجتمع المدني. وفي لجنة 37 ، 38 بمدرسة حلوة بمركز مطاي بمحافظة المنيا، تم منع المتابعين من دخول اللجان رغم أنهم يحملون تصاريح اللجنة العليا للانتخابات. وفي بني سويف، رفضت قوات التأمين دخول بعض المراقبين بمقر لجنة رقم 36 بمدرسة الشهيد أنور السادات دون إبداء أسباب. أما عن الدعايا الانتخابية، رصد التحالف المصري لمراقبة الانتخابات أن اللجنة رقم 17 بمدرسة الثانوية القديمة بنات بمحافظة المنيا شهدت وجود فتاة ترتدي تي شيرت يحمل صورة المشير السيسي أمام اللجنة وبيدها مكبر صوت يردد أغاني لذات المرشح، إلى جانب وجود بنر دعائى لحملة المرشح صباحى على أبواب المقر الانتخابى بمدرسة أبناء الثورة الابتداية بالمحافظة. وفي محافظة الأقصر، رصد التحالف المصري لمراقبة الانتخابات وجود دعاية بجوار اللجنة 5 بمدرسة الابتدائية المشتركة للمرشحين حمدين والسيسى عن طرق رفع صور كلٍ من المرشحين. وفي محافظة الدقهلية، أشار التحالف المصري لمراقبة الانتخابات إلى وجود مقارات دعائية للمرشح عبد الفتاح السيسى فى شوراع مدينة الكردى والرياض التابعين لمدينة منية النصر، إلى جانب وجود مكبرات صوت وتشغيل أغنية "تسلم الأيادي" في مدرسة القومية، إضافة إلى قيام جبهة "مصر بلدي" بإصدار كرنيهات للناخبين تشبه كرنيهات المتابعة الصادرة من اللجنة العليا للانتخابات لتوجيه أعضائها للناخبين للتصويت لصالح السيسي. وفي دمياط، شهدت مدرسة عثمان بن عفان الثانوية وجود سيارة ملاكي (ط د س - 7473) تحمل صور كبيرة للمرشح الرئاسي عبد الفتاح السيسي. وفي محافظة الوادي الجديد، رصد التحالف المصري لمراقبة الانتخابات وجود دعاية أمام للمرشح عبد الفتاح السيسي أمام اللجان رقم 7 و 8 بمدرسة الناصر الإعدادية المشتركة بالمحافظة. في سياق متصل، رصدت المنظمة المصرية، وجود أعمال عنف وبلطجة بالفيوم، حيث تم إبطال مفعول قنبلة بدائية الصنع بصندوق قمامة بالساعة العاشرة صباحًا، في مدرسة جمال عبد الناصر الثانوية، بالإضافة لقطع الأخوان المسلمين طريق كعابي حتى سيطرت عليهم قوات الأمن في تمام الساعة الحادية عشر وأربعين دقيقة، حيث أشعلوا النيران في السيارات، وتكسير أي عربية تتجاوز الطريق، بجانب إنفجار عبوة ناسفة بقرية المشرك قبلي بمركز يوسف الصديق، بلجنة رقم 28 بمدرسة أبو بكر الصديق الابتدائية، ولم تسفر عن أي إصابات. كما رصدت وجود انتهاكات داخل وخارج اللجان الانتخابية، بعدة محافظات، وتشمل المنيا، حيث تبين عدم وجود كشوف للناخبين داخل لجنة رقم 2 بمدرسة الإتحاد الإعدادية، ولجنة 5 بمدرسة الأمهات في مركز ديرمواس، ولجان 57 و 58 و 59 بمدرسة البرجاية الأعدادية بمركز المنيا، ولجنة رقم 25 بمدرسة الثورة البتدائية، في حين كانت لجنة 21 لنفس المدرسة بها صندوق انتخابى مكتوب عليه لجنة رقم 60 وعندما تدخل متابع المنظمة وطلب تصحيح الخطأ قام المستشار بنزع الورقة. فيما تواجد جهاز "لاب توب" بلجنة رقم 24 بمدرسة صف الشرقية الإعدادية مع أحد المواطنين لإستخراج أرقام الناخبين، وآخر أمام لجان رقم 19 ، 20 بمدرسة القومية، كما لم يتم تدوين رقم اللجنة 20 على الصندوق الانتخابي الخاص بها لنفس المدرسة. بينما رصد في محافظة شمال سيناء، أن بعض الناخبين لم يجدوا أسماؤهم بالكشوف الإنتخابية على الرغم من وجودها على الموقع بلجان مدرسة أبو صقل الإعدادية.