أشادت الجماعة الإسلامية بقرار الرئيس محمد مرسي بالعفو الشامل عن ثوار 25 يناير، معتبرة أنه خطوة في اتجاه تحقيق أهداف ثورة 25 يناير يرفع الظلم والجور عن المعارضين السياسيين والمطالبين بتحقيق أهداف الثورة . وقالت الجماعة الإسلامية في بيان لها أنها تنتظر من الرئيس المنتخب محمد مرسي التعامل مع معارضي نظام مبارك الفاسد قبل الثورة بنفس المقياس وإصدار قرار بالعفو الشامل عن كل معارضي مبارك خلال الثلاثون عاماً الماضية خاصة أنهم تعرضوا لمحاكمات استثنائية ظالمة كما عانوا الظلم والقهر والتعذيب في السجون والمعتقلات وكانوا أول من وقف ضد فساد مبارك وظلمه.