أكد الدكتور والعالم المصري محمد غنيم عضو مجلس أمناء جامعة زويل إن المشكلة التي أثيرت بشأن جامعة النيل وجامعة زويل تعد بسيطة إذا كان الهدف واحد وهو المشروع العلمي التنموي الذي سيساعد على نهضة مصر . ووصف غنيم المشكلة منذ بدايتها إن مجلس الأمناء السابق لجامعة النيل قاموا بالتنازل التام عن أرض جامعة زويل لوزارة الاتصالات وذلك حينما كان رئيس الوزراء هو الفريق احمد شفيق وتم إعادة التخصيص حينما صرح الدكتور عصام شرف باستخدام جامعة زويل للمباني التي تخص وزارة الاتصالات والخلاف الآن بين جامعة النيل والحكومة المصرية. وأعلن الدكتور محمد غنيم خلال مداخلة هاتفية ببرنامج آخر النهار مع الإعلامي محمود سعد أن الاتفاق الذي تم كان ينص على نقل الطلاب والباحثين وأعضاء هيئة التدريس بجامعة النيل إلى جامعة زويل وان يعملوا جميعا تحت مظلة أن هذه عملية اندماجية ولكن شرطا ان تظل الجامعة بنفس الشكل الأكاديمي والإداري والعلمي التي كانت تدار به جامعة النيل وهذه هي نقطة الخلاف لأن جامعة زويل ليست جامعه خاصه وإنما مؤسسة علمية .