أعلن حزب التيار المصري موقفة المبدئي من انتخابات الرئاسة بجولة الاعادة بين كلا من الفريق أحمد شفيق و د . محمد مرسي مرشح حزب الحرية و العدالة وقد أجري التصويت بين أعضاء الحزب على اختيار محمد مرسي لإسقاط مرشح مبارك "شفيق "والثورة المضادة-علي حد تعبيرهم، أومقاطعة الانتخابات وإبطال الصوت". وكانت النتيجة"دعم مرسي بنسبة 66.8 % وذلك في مقابل 31 % مع مقاطعة الانتخابات أو إبطال الصوت، في حين امتنع 2.2 % ممن حضروا عن التصويت لأحد الاختيارين. وان اختيار الحزب لدعم الدكتور محمد مرسي جاء كاختيار "الأنسب" بالنظر لما آلت إليه العملية الانتخابية، مع التأكيد على اختلافنا معه ومع الفصيل الذي يمثله في برنامجه وأجندته السياسية، فضلا عن غالبية المواقف السياسية منذ بداية الثورة و أضاف الحزب إن اختيارات اعضاء الحزب تمثل قناعاتهم و انحيازهم للمبدأ، ورفضهم لتمييع المواقف أو الوقوف على الحياد في مثل تلك الظروف الفاصلة، وإصراراً لا هوادة فيه على عزل مرشح مبارك ان لم يكن بالقانون فبالصندوق.