بعد إعلان اللواء رؤوف السيد نائب رئيس حزب الحركة الوطنية بأن المؤتمر الشعبي الذي سينظمه الحزب الشهر القادم سيعلن الفريق أحمد شفيق خوضه معركة الانتخابات الرئاسية القادمة والمُقرر عقدها 2018، طارد شبح الاستقالات الحزب بمختلف محافظات الجمهورية واعترض مقدميها على السياسية التي يتبعها الحزب مؤخرًا بعقد تحالف الفريق مع الإخوان لنجاحه في الانتخابات القادمة. استقالة أمين الجيزة بدأت موجه الاستقالات من المهندس أسامة الشاهد عضو الهيئة العليا لحزب الحركة الوطنية من الحزب، وقال في بيان مقتضب: "تقدمت بالاستقالة من الحزب وجميع المناصب التي أتولاها تنظيميا، للتفرغ الكامل لرعاية شئون أسرتي وأعمالي". وبعد ساعات من إعلان الشاهد استقالته، نشرت معلومات تؤكد أن السبب الرئيسي للاستقالة كانت بسبب السياسات الأخيرة التي يتبعها كل من اللواء رؤوف السيد نائب رئيس الحزب وأحمد الضبع الأمين العام بعد لجوءهم للإخوان المسلمين لدعم الفريق شفيق في الانتخابات الرئاسية القادمة. استقالات الإسكندرية وبعدها، قدم المهندس محمد الحلو أمين عام حزب الحركة الوطنية بمحافظة الإسكندرية استقالته، مؤكدًا أن السياسات التي ينتهجها حزب الحركة الوطنية في الفترة الأخيرة تتسم بالتخبط وإعلاء الصالح الخاص على حساب مصالح الحزب وأعضائه، وتحقيق أهداف عدد من الأشخاص وهو الأمر غير المقبول شكلا وموضوعا وعلى كل المستويات، كما أنه يتنافى مع أخلاق ومبادئ العمل السياسي والحزبي. وأشار أمين عام حزب الحركة الوطنية بالإسكندرية في نص استقالته، إلى أن هناك سياسات متخبطة من قيادات الحزب وحالة من العبث بمقدراته والتحالف مع أعداء الوطن لتحقيق المصالح الخاصة للبعض، وبعد إعلان الحلو استقالته تقدم كافة أعضاء ومسئولي هيئات مكاتب الأمانات النوعية لحزب الحركة الوطنية بالإسكندرية باستقالة جماعية على خلفية سياسات الحزب وتحالف عدد من قياداته مع الإخوان لمساندة الفريق شفيق في الانتخابات الرئاسية. انتفاضة الإسماعيلية وهذا ما أكده المهندس محمد جبر أمين حزب الحركة الوطنية بالقصاصين في محافظة الإسماعيلية بأن هناك قيادات بالحزب تحالفت مع جماعة الإخوان لمساندة الفريق أحمد شفيق في الانتخابات الرئاسية القادمة إلى أنه تقدم باستقالته في النهاية، وتقدم أيضًا حسام الدين مصطفي أمين قسم ثاني حزب الحركة بالإسماعيلية باستقالته اعتراضًا علي سياسة الحزب التي تتخذ مواقف معادية للدولة من خلال هيئة الأمانة العامة بالقاهرة من أجل تحقيق مصالح وأغراض شخصية. استقالات بورسعيد كما تقدمت أمينتا المرأة والعلاقات الخارجية بحزب الحركة الوطنية فى بورسعيد، باستقالتهما من منصبهما، وتقدمت المهندسة نهير أحمد السيد دره أمينة العلاقات الخارجية بالحزب باستقالتها من أمانة الحزب، وأعلنت عن عدم انتمائها لأي حزب سياسي، كما تقدمت رضوى مصطفي البراموني أمينة المرأة بالحزب ومساعدة القائم بأعمال المرأة على مستوى الجمهورية. هؤلاء أيضًا تقدموا باستقالاتهم كما تقدم اللواء سمير عيد أمين الشئون الإدارية والمالية، والعقيد إيهاب موسى ونهير أحمد السيد أمينة العلاقات الخارجية أعضاء الهيئة العليا لحزب الحركة الوطنية وذلك بعد الاستقالات الجماعية التي شهدها الحزب في كل من أمانة الإسكندرية وبورسعيد والإسماعيلية، وأكد المستقيلون أن الاستقالة جاءت اعتراضًا على السياسات التي ينتهجها الحزب في الفترة الأخيرة وتعاونهم مع الإخوان، بالإضافة إلى قرارات وتوجهات نائب رئيس الحزب اللواء رؤوف السيد والأمين العام أحمد الضبع التي لا يتم عرضها على أعضاء الهيئة العليا ولا الأمانات، مما تسبب في انشقاقات الحزب لأكثر من جبهة وتقدم العديد من أعضاء الحزب باستقالتهم. يذكر أن حزب الحركة الوطنية المصرية قد عقد مؤتمرًا تنظيميًا في مارس 2017 دشن خلاله الهيكل التنظيمي الجديد بإجراء حركة تغييرات واسعة النطاق في المراكز والأقسام على مستوى العاصمة.
