وافق المجلس الأعلى للجامعات، على إدراج درجة ماجستير البيوتكنولوجي في مجال العلوم الزراعية والعلوم البيئية، التابع لمشروع ال"Tempus" والممول من الاتحاد الأوروبي بجامعة الفيوم، بكليات "الزراعة والعلوم والطب البطري"؛ بعد تقييم برنامج البكالوريوس الخاصة بهم لتحديد علاقتها بالبرنامج. ويشمل البرنامج (العلوم الزراعية) وبرنامج (العلوم البيئية) لخريجي كليات العلوم والعلوم البيئية والعلوم التطبيقية وخريجي كليات الزراعة والمعاهد الزراعية، وكليات الهندسة (قسم الهندسة الطبية) وكليات التكنولوجيا الحيوية و(كليات الطب البيطري).