استنكر وزير الأوقاف، الدكتور محمد مختار جمعة، استهداف بعض الجماعات الإرهابية للمساجد، مؤكداً أن ذلك يرجع إلى التوظيف السياسي للدين والمتاجرة به لتحقيق مصالح حزبية أو طائفية، وأنه يجب إبعاد المساجد ودور العبادة عن أي صراعات سياسية أو حزبية أو طائفية، فالمساجد لما يجمع ولا يفرق، فينبغي أن تكون وجهتها خالصة لله وحده، "وَأَنَّ الْمَسَاجِدَ لِلَّهِ فَلَا تَدْعُوا مَعَ اللَّهِ أَحَدًا" (الجن:18) . وطالبت وزارة الأوقاف، بتغليظ العقوبة على من يستهدف دور العبادة بأعمال إرهابية، أو من يتخذها منطلقا للأعمال الإرهابية، أو يتجاوز في حقها أي تجاوز لا يتناسب مع حرمتها وقداستها وشرفها وطهارتها.