قال المهندس جمال دويدار نائب، رئيس هيئة السكة الحديد للمسافات الطويلة، إن قطار رقم 165 المميز القادم من أسيوط إلى القاهرة كانت الإشارة مفتوحة أمامه بالسير معتمدًا على أن مزلقان منطقة المندرة التى وقع عندها الحادث مغقلقًا، إلا أن سائق القطار فوجئ بالأتوبيس رقم 2032 "مينى باص" أمامه فأطاح به مما أدى إلى مصرع وإصابة 74 تلميذًا، خاصة أن الأتوبيس تابع لإحدى مدارس منفلوط. وأضاف دويدار أن السبب فى وقوع الحادث هو عامل مزلقان المندرة الذى تركه مفتوحًا، وقد أبلغ قطاع المتابعة بالقاهرة أنه نسى إغلاق المزلقان، مما أدى إلى وقوع الحادث.