طالب الشيخ خالد الجندي، عضو المجلس الأعلى للشئون الإسلامية، الأزهر الشريف ووزارة الأوقاف ومجمع البحوث الإسلامية، هيئة كبار العلماء، بالرد على تصريحات الدكتور يوسف زيدان، حول التشكيك في قراءات وتفسير القرآن، قائلًا: «هو أنتم خائفون، وهل السكوت له حكمة، فهذه كارثة، فلم يرد أحدٌ عليه، فهذا السكوت يعد صمتًا تآمريًا». وقال «الجندي»، خلال حلقة برنامج «لعلهم يفقهون»، المٌذاع على فضائية «dmc»، اليوم الاثنين: «يا سيادة وزير الأوقاف، الأديب المعروف يوسف زيدان يزعم أن المساجد «دلع ماسخ»، فهذا الرجل يضرب فى أساس شغلك يا سيادة الوزير، أين احترام وتوقير مساجد الله».