استقبل شعب النمسا البابا تواضروس الثانى بمطار فيينا مساء يوم الاثنين الموافق 9 ديسمبر 2013 م، وكان في استقباله بالمطار خالد شمعة -سفير مصر بالنمسا- وأعضاء السفارة المصرية بالنمسا، وحشد كبير من الكهنة و الشعب القبطي. بدأ البابا الزيارة بإلقاء محاضراته بكلية البابا شنوده الثالث في الكلية الإكليركية بالنمسا، وهى الكلية التى شارك في حفل افتتاحها قبل اختياره بطريركا بثلاثة أشهر. وقد تخللت الزيارة عدة اجتماعات ولقاءات وأنشطة أخرى، حيث قام بتكريس ثلاثة من طالبي الرهبنة بدير القديس الأنبا أنطونيوس بأوبرزيبين برون بالنمسا. وقام في يوم السبت 14 ديسمبر، بتدشين كنيسة الشهيد مارجرجس بمدينة لينز، حيث حضر أسقف الكنيسة الكاثوليكية د.لودفيج أشفرتس، وقد قام بسيامة عدد كبير من أطفال وشباب الكنيسه لرتبة الشماسية، وفي مساء السبت حضر البابا حفل تخرج دفعة جديدة من طلاب شهادة الثانوية العامة بالنمسا. كما ترأس صلاة القداس الإلهي بمطرانية عذراء الزيتون بفيينا، في صباح الأحد 15ديسمبر، وقام بسيامة الدياكون"رتبة من الشمامسة أى المُرتلين": باخوم قسًا عامًا على كنائس النمسا-باسم القس باخوميوس- كما قام بسيامة عدد كبير من الشمامسة من أبناء الكنيسة وسط فرحة لشعب الكنيسة. وقام بتعميد بعض أطفال الكنيسة، وحضر خطوبة اثنين من شباب الكنيسة، مشاركًا الحضوراحتفالهم، بالإضافة إلى ذلك، قام البابا بعقد عدة اجتماعات مختلفة مع الشباب وشعب إيبارشية النمسا، وقد قدمت فرقة الموسيقى والكورال بالكنيسة بعض الترانيم الروحية وقدموا ترنيمة خاصة عن مصر. واختتم البابا زيارته بإلقاء عدة محاضرات بكلية البابا شنودة الثالث بالنمسا، وفي يوم الأربعاء 18 ديسمبرغادر النمسا في طريقه إلى ألمانيا، وكان في وداعه بمطار فيينا الدولي، خالد شمعة -سفير جمهورية مصر العربيه بالنمسا- ومحمد الفيل -قنصل مصر العام بالنمسا.