أيدت حركة 6 إبريل, قرار الرئيس محمد مرسي, بالإفراج عن معتقلى الثورة فى المرحلة الانتقالية قائلة:" قرار رائع يستحق الإشادة". وقال محمود عفيفي المتحدث باسم الحركة في تدوينة له : "قرار الرئيس مرسى بإصدار مرسوم بقانون بالعفو الشامل عن معتقلي الثورة من 25 يناير الي 30 يونيو 2012 قرار أكثر من رائع يستحق الإشادة والتحية". وأضاف : "مازلنا ننتظر الانتصار لدماء الشهداء بإعادة المحاكمات بأدلة اتهام جديدة، كما وعد من قبل ومازلنا ننتظر تحويل المجلس العسكرى إلى المحاكمة .. المجد للشهداء".