أعاد المجلس الأعلي للأزهر مرة أخري فتح الباب للالتحاق بالكليات الشرعية بجامعة الأزهر أمام الحاصلين علي مؤهلات عليا من الجامعات المصرية بشرط أن يكون بنظام الانتساب. واشترط المجلس أن تعقد الجامعة امتحاناً في المواد الشرعية والعربية وحفظ القرآن الكريم المقرر علي طلاب الشهادة الثانوية تحريراً وشفوياً وان يكون القبول انتساباً فقط كما وافق المجلس علي اقتراح الجامعة بالإعلان عن وظائف معيدين بكلية الطب بدمياط بحيث يشمل دفعات 2001 وما قبلها. ووافق المجلس علي اقتراح قطاع المعاهد الأزهرية باعتبار القرآن وعلومه بالمرحلة الثانوية لمعاهد البعوث الإسلامية مادة واحدة مكملين لبعض "شفوي وتحريري" وبسؤال واحد وحصة واحدة. وتدريس اللغة الإنجليزية للطلاب الوافدين بمعاهد البعوث واختيار إحدي اللغتين "الإنجليزية والفرنسية" للطلبة الوافدين والملحقين بالمعاهد الأزهرية بالقسم الأدبي علي أن يحسب رسوب الطالب في مادة القرآن الكريم ومادة التجويد شفوياً وتحريرياً مادة رسوب واحدة وذلك اعتباراً من العام الدراسي 2007. ..2008 كما وافق المجلس علي انشاء الأقسام العلمية بشعب كليتي البنات الأزهرية بطيبة الجديدة والعاشر من رمضان.