قال كوستاس ليتزيراكيس، رئيس هيئة الطيران المدنى اليوناني، إنه "لم يبلغ الطيار المصري عن أي مشاكل بالطائرة التي اختفت قبل إقلاعها". وقال رئيس هيئة الطيران المدني اليونانية، إن طائرة تابعة لشركة مصر للطيران، على متنها أكثر من 50 شخصًا اختفت من على شاشات الرادار بعد دقيقتين من مغادرة المجال الجوى اليونانى فى وقت مبكر اليوم الخميس. وتحدث المراقبون الجويون مع الطيار فوق جزيرة فيما يعتقد أنه كان آخر اتصال بالطائرة. وغادرت الطائرة المجال الجوى اليونانى الساعة 3.27 صباحا بالتوقيت المحلى (0027 بتوقيت جرينتش) ودخلت المجال الجوى المصري. وقال ليتزيراكيس إنه بعد ذلك بدقيقتين اختفت من على شاشات الرادار اليونانية. وكانت مصر للطيران قد أكدت أن الطائرة أطلقت إشارات استغاثة قبل اختفائها مباشرة.