طالب مجلس شورى العلماء بعودة الرئيس المعزول محمد مرسي إلى منصبه ، وتشكيل حكومة كفاءات وطنية ، وطالب كذلك بالإسراع في إجراء الإنتخابات البرلمانية ، وترك أمر النظر في استمرار مرسي للبرلمان بعد تشكيله . أصدر مجلس شورى العلماء بيانه الثالث والثلاثين مساء الأحد ، وطرح فيه ما رأي للخروج من الأزمة وعودة الشارع لحالته الطبيعية وتهدئة جموع الشعب المصري وصيانةً لدمائه بحسب البيان . وطالب بتشكيل الحكومة من أغلبية مجلس الشعب بعد انتخابه ، وترك أمر النظر في بقاء مرسي للبرلمان. وطالب كذلك بإيقاف حملة الإعتقالات الأخيرة ، والسعي في عقد المصالحة الوطنية بين جميع الأطراف . وأكد مجلس شورى العلماء أن ما صدر من المجلس العسكري ، ما هو إلا اجتهاد خاطئ ، قصد به مصلحة البلاد والعباد ، ونصحهم بالعودة للحق . ويرأس مجلس شورى العلماء الدكتور عبدالله شاكر ، وينوب عنه الشيخ محمد حسان ، ويضم كلاً من الشيخ أبو إسحاق الحويني والشيخ محمد حسين يعقوب و آخرين.