هناك العديد من الفوائد للزعتر، حيث إنه يحسن من الصحة العامة للإنسان، ونتناول فيما يلي أهم فوائده: -خفِض نسبة الكولسترول الضار في الدم، وينظِم ضغط الدم، ويعزز صحة ووظائف عضلة القلب، والصمامات والأوعية الدموية، وينظِّم معدل ضربات القلب. -يحفز أداء الجهاز المناعي ويساعده على مقاومة الأمراض، وذلك لاحتوائه على فيتامين (ج) وفيتامين (أ). -يعالج الأكزيما: أفادت دراسة أجراها فريق من جامعة أديس أبابا أنه تم شفاء (66.5)% من المصابين بالأكزيما الذين عولجوا باستعمال كريمات تحتوي على (3%) من الزعتر، في المقابل تمّ شفاء (28.5)% فقط من أولئك الذين عولجوا باستخدام دواء وهمي. -يحتوي الزعتر على زيوت أساسيّة، ومادة الثيمول التي تمتلك خصائص مضادة للفطريات، والبكتيريا، والفيروسات، والبعوض، لذلك يستخدم الزعتر كمطهر في المنازل من العفن، ويدخل في تركيب المبيدات الحشرية، وغسول الفم، ومزيلات روائح العرق. -يحسن الصحة النفسية والمزاج، لأنه يحتوي على مادة "كارفاكرول التى تؤثر على نشاط الخلايا العصبيّة المسؤولة عن الشعور بالسعادة. -يعالج الإسهال، والتبول اللاإرادي، وغازات الأمعاء. -يقتل 98٪ من الخلايا السرطانيّة عند المصابين بسرطان الثدي.