شهد مجلس النواب، عددًا من حالات الوفاة والاستقالة وإسقاط العضوية؛ حيث شهد 5 حالات وفاة، و4 حالات استقالة. وكانت أولى حالات الوفاة؛ للنائب سامح سيف اليزل، منسق ائتلاف دعم مصر السابق، فى 4 إبريل 2016، بعد تدهور حالته الصحية، ثم محمد مصطفى الخولى، عضو مجلس النواب السابق عن دائرة مركز الفيوم، فى ذات الشهر، إثر إصابته بأزمة قلبية مفاجئة، وسيد فراج، عضو مجلس النواب عن دائرة حدائق القبة بالقاهرة، بعد صراع طويل مع المرض، فى 12 يوليو 2016. كما توفيت أميرة رفعت، عضو المجلس عن دائرة شبين الكوم بالمنوفية، فى 9 أكتوبر 2016، إثر حادث سيارة، بينما كانت فى طريقها إلى شرم الشيخ، لحضور احتفالية البرلمان بمناسبة مرور 150 عامًا على بدء الحياة النيابية فى مصر، كما توفى النائب هرقل وفقى، عن دائرة جرجا فى سوهاج، فى 26 يوليو 2017. كما أسقط المجلس فى 25 مارس 2016، عضوية النائب توفيق عكاشة، بسبب لقائه مع السفير الإسرائيلى، وفى 27 فبراير 2017، أسقطت عضوية محمد أنور السادات، بتهمة الإساءة للبرلمان، باعتبارها مؤسسة من مؤسسات الدولة، بسبب اتهامه بتزوير توقيعات النواب على مشروعى قانونى الإجراءات الجنائية والجمعيات الأهلية، كما أعلن المستشار سرى صيام، عضو مجلس النواب المعين، استقالته فى بداية أعمال البرلمان، فيما استقال الدكتور على مصيلحى، رئيس لجنة الشئون الاقتصادية، بعد اختياره لتولى منصب وزير التموين.