أكد القرار الوزاري المنظم لاليات العمل ونظام الدراسة والامتحانات ب مدارس المتفوقين والموهوبين بكافة أنواعها، في الباب الثانى المتعلق (بمدرسة المتفوقين بعين شمس) على أن مدرسة المتفوقين بعين شمس هي مدرسة ثانوية رائدة في مجال مدارس المتفوقين يلتحق بها المتفوقون في الشهادة الإعدادية لمساعدتهم على مواصلة التقدم والتفكير والبحث العلمي والابتكار. واوضح القرار في مادته الرابعة ان نظام الدراسة بمدرسة المتفوقين الثانوية بعين شمس يكون باللغة العربية، طبقا لنظام البكالوريا المصرية في كل من مسار الطب وعلوم الحياة، ومسار الهندسة، وعلوم الحاسب، ويختار الطالب أحد المسارين بعد النجاح في الصف الأول الثانوي. يذكر ان أصدر محمد عبد اللطيف وزير التربية والتعليم والتعليم الفني القرار رقم (303) بشأن إعادة تنظيم العمل ونظام الدراسة والامتحانات بمدارس المتفوقين والموهوبين بكافة أنواعها، وذلك بعد موافقة المجلس الأعلى للتعليم قبل الجامعي. وتضمن القرار في الباب الأول المادة الأولى أحكاما عامة بمدارس المتفوقين الثانوية في العلوم والتكنولوجيا بكافة أنواعها والتي تهدف إلى ما يلي: - رعاية المتفوقين في العلوم والرياضيات والهندسة والتكنولوجيا، والاهتمام بقدراتهم. - تعظيم دور العلوم والرياضيات والهندسة والتكنولوجيا في التعليم المصري. - نشر نظم التعليم الحديثة الخاصة بالطلاب المتفوقين في المجالات المذكورة في البندين السابقين مثل نظام (STEM)، وغيره من الأنظمة التعليمية المكافئة له بالمدارس المصرية. - تشجيع التوجه نحو التخصصات العلمية لدى نسبة كبيرة من الطلاب في المرحلة الثانوية. - تطبيق مناهج وطرق تدريس جديدة تعتمد على المشروعات الاستقصائية، والمدخل التكاملي في التدريس. - إكساب وتنمية ميول ومهارات الطلاب، وزيادة مشاركتهم، وتحصيلهم في العلوم والرياضيات. - تحقيق التكامل بين مناهج العلوم والرياضيات، والتكنولوجيا، والهندسة، بما يكشف عن مدى الارتباط بين هذه المجالات لإعداد طالب لديه القدرة على التصميم والإبداع والتفكير النقدي. - إكساب الطلاب مهارات التعلم التعاوني. - إعداد قاعدة علمية متميزة ومؤهلة للتعليم الجامعي والبحث العلمي