فور علمه بالحادث الأليم لقطار البدرشين, تابع الدكتور هشام قنديل رئيس مجلس الوزراء التطورات أولا بأول, وأجري عددا من الاتصالات بالسادة وزراء الدفاع والداخلية والنقل لمتابعة الموقف واتخاذ الإجراءات العاجلة اللازمة, كما توجه رئيس الوزراء لموقع الحادث والتقي بالقيادات الأمنية, والأطقم الطبية التي تقوم بعمليات الإنقاذ والإسعاف. عقب ذلك زار د. قنديل المصابين بمستشفي المعادي العسكري للاطمئنان عليهم, كما تبرع بالدم في المستشفي لصالح مصابي الحادث. وأكد رئيس الوزراء وضع جميع المستشفيات في حالة تأهب قصوي لاستقبال كل المصابين والعناية بهم, ووجه بإجراء تحقيق فوري لمعرفة أسباب الحادث, وتحديد المسئولين, ومعاقبة المقصرين. وفي الوقت الذي عبر د. قنديل عن حزنه وأسفه الشديد لوقوع الضحايا الذين لا يعوضون, فقد قرر رئيس الوزراء صرف مبلغ30 ألف جنيه فورا لأسر المتوفين, ومبالغ مالية للمصابين وفق درجة الإصابة, بالإضافة إلي تعويضات من القوات المسلحة. كما يتابع رئيس الوزراء لحظة بلحظة تطورات الموقف مع الجهات المعنية بوزارات الدفاع والداخلية والصحة والنقل.