كشفت تحقيقات النيابة أن السبب في حادث قطار البدرشين وانقلاب عربيتي المترو هو ضعف الرقابة من جانب مسئولي وزارة النقل وهيئتي السكة الحديد والمترو. وأضافت أن ناظر محطة المرج القديمة يسمح لمسئولي الإشارات بالدخول لغرفة الأجهزة دون التأشير علي كشف قيد القطارات, ويوافق علي عمل الكوبري علي الريليه كابل التشغيل بالإضافة إلي تقاعس المسئولين بالشركة المصرية لتشغيل المترو عن تركيب كاميرات داخل أو خارج غرفة التحكم الخاصة بالمحطة ساهم في وقوع الحادث. وأوضحت التحقيقات أن العمال الفنيين في السكة الحديد يصلحون الأعطال يدويا دون تقييم حقيقي لنجاح الإصلاح في منع الحوادث. وأضافت أن مسئول برج المراقبة بمحطة المرازيق أكد أن زميله في الوردية السابقة أبلغه بوجود عطل في سويتش التحويلة وتم إجراء تجربة فعملت, وبعدها وقع الحادث. كما أن كهربائي المحطة كشف عن قيامه بإصلاح العطل يوم الخميس السابق للحادث, مؤكدا أن السويتشات الجديدة أعطالها كثيرة ولا يتم تغييرها إلا بعد تلفها نهائيا.