استنكرت لجان التنسيق المحلية في سوريا تدخل زعيم تنظيم القاعدة أيمن الظواهري في الشأن السوري، وقال إن محاولة الظواهري ركوب موجة الاحتجاجات في سوريا، تعكس الإفلاس الفكري الذي وصلت إليه القاعدة. وأضاف محمد العبد الله المتحدث باسم لجان التنسيق السورية في تصريح لراديو /سوا / الأمريكي أمس أن " تصريحات الظواهري مرفوضة، مشيرا إلى أن تنظيم القاعدة شعر بعد انتصار الثورات السلمية بأن الطابع السلمي والنضال اللاعنفي مجد أكثر ومكلف أقل، وجدواه أكثر بكثير حيث إنه أجبر العديد من الرؤساء على التنحي عن مناصبهم" . وأوضح المتحدث أن تنظيم القاعدة شعر بالإفلاس الفكري والأيديولوجي خصوصا بعد مقتل زعيم تنظيم القاعدة إسامة بن لادن الذي لم يلق أي رد فعل في العالم العربي، لذلك فإن هناك محاولة لركوب هذه الموجات وانتقاد الثورات. وأضاف أن الوضع في اليمن متأزم، "هناك وجود قديم للتنظيم في ولايات محدودة، وأن الساحة الوحيدة التي يمكن أن يحاول الظواهري أن يعبث بها هي الساحة السورية، ومعلوم في سوريا أننا لا نملك لا تنظيما للقاعدة ولا حتى متعاطفين مع هذا التنظيم . وكان تنظيم القاعدة قد بث رسالة من زعيمه الجديد أيمن الظواهرى في وقت سابق إلى المحتجين ضد نظام الحكم فى سوريا والرئيس بشار الأسد من خلال مقطع فيديو عبر موقع التنظيم على شبكة الإنترنت، وصف فيها بشار الأسد بأنه زعيم لعصابات إجرامية وحامى الخونة، مثنيا على الحركة الاحتجاجية التى تشهدها البلاد ضد نظامه.