في إطار الخطة الدعوية الشاملة لوزارة الأوقاف لنشر الوسطية والاعتدال ومواجهة التطرف، وضعت الوزارة خطة لمواجهة ظاهرة الالحاد، وذلك بالتعاون مع وزارة الشباب والرياضة. وتهدف الخطة لتوعية الشباب بخطورة الإلحاد على العقيدة والأخلاق والانتماء الوطني، ومعالجة شبهات الملحدين نفسيًا وإيمانيًا واجتماعيًا من خلال فريق عمل متكامل فd كل التخصصات المعنية. يتم ذلك من خلال التعاون والتنسيق الكامل بين وزارتي الأوقاف والشباب والرياضة، بعد موافقة الدكتور محمد مختار جمعة وزير الأوقاف على الخطة التي عرضها الشيخ أحمد ترك مدير عام بحوث الدعوة بالوزارة، والتي أعدها مجموعة من علماء وزارة الأوقاف، وخبراء الطب النفسي وعلم الاجتماع لمواجهة الفكر الإلحادي. وتتضمن الخطة جمع ودراسة كل شبهات الملحدين والقيام بتفنيدها والرد عليها، وتلقي التدريب اللازم على أيدي أساتذة متخصصين في علم النفس والاجتماع والعقيدة الإسلامية الصحيحة، لفريق العمل الشبابي قبل بدء المهام الموكلة إليه، تدريب مجموعة من شباب الجامعات والشباب العائد من تجربة الإلحاد، وتأهيلهم للمشاركة في مواجهة الظاهرة، وضمهم إلى المبادرة، إطلاق حملة وقائية للشباب بكل فئاته. كما تتضمن الخطة استهداف البؤر التي ينتشر فيها الإلحاد، وعمل برنامج تدريبي للأئمة وكذلك بعض الشباب للمساهمة في هذه المبادرة، إطلاق صفحة على موقع التواصل الاجتماعي " الفيس بوك" تحمل اسم مبادرة "بالعقل كده"، التواصل إليكترونيا مع الشباب للرد على أسئلتهم والرد على شبهات الملحدين ومساعدة ذويهم في معالجة المشكلة اجتماعيًا داخل الأسرة، وإطلاق خط ساخن يتبع وزارة الشباب للتعامل مع أسر الملحدين وتقديم المساعدة لهم علميًا ونفسيًا، تكوين لجنة استشارية من كبار علماء الأزهر لدعم فريق العمل في الرد على الشبهات.