رصد تقرير برنامج الحريات الأكاديمية والحقوق الطلابية بمؤسسة حرية الفكر والتعبير الانتهاكات التي شهدتها الجامعات المصرية، خلال الفترة من 9 إلى 14 نوفمبر الحالي، واعتبر هذه الفترة الأسوأ منذ بداية الدراسة في الجامعات، حيث شهد هذا الأسبوع أشكال الانتهاكات كافة، بدءًا باقتحام قوات الشرطة لحرم الجامعة، وإلقاء قنابل الغاز المسيل للدموع، وإطلاق الخرطوش على الطلاب، مما أدى إلى سقوط العشرات من المصابين بين صفوف الطلاب، وصولًا إلى اعتقال الطلاب من داخل الحرم، ومداهمة منازل آخرين فجرًا وإلقاء القبض عليهم. وقال التقرير: استمر وجود مجهولين مدنيين مصاحبين لقوات الشرطة داخل الحرم الجامعي، أثناء الاعتداء على الطلاب، علاوة على ارتفاع حالات الفصل بين الطلاب بشكل ملحوظ في جامعات مختلفة، منهم رؤساء اتحادات لكليات وجامعات، كما يوجد حالات تم فصل الطلاب دون إجراء تحقيق مسبق. وترى مؤسسة حرية الفكر والتعبير أن المرحلة الحالية تعد الأسوأ، التي تشهدها الجامعات المصرية منذ ثورة الخامس والعشرين من يناير، كما ترى أنها الأخطر على الإطلاق من حيث تهديد الحريات الطلابية والجامعية، والتأثير على استقلال الجامعات، بالإضافة إلى تهديد حياة الطلاب أنفسهم، وتهديد العملية التعليمية وانتظامها وجدواها، وهو ما يحتاج إلى حل فوري وجاد للوضع المتردي في الجامعات، عوضًا عن الحل الأمني العنيف الذي يزيد الأمر سوءًا. ورصد التقرير في 12 نوفمبر بجامعة المنصورة اقتحام مجهولين بزي مدني مصاحبين لقوات الشرطة بوابة جامعة المنصورة، واشتبكوا مع مسيرة لحركة "طلاب ضد الانقلاب"، تطالب بعودة الرئيس المعزول "محمد مرسي" وإقالة رئيس الجامعة الدكتور سيد عبد الخالق، بالإضافة إلى إطلاق قوات الشرطة الغاز المسيل للدموع داخل الجامعة واستمرت الاشتباكات لساعات بين الطلاب من ناحية وقوات الشرطة وبلطجية من ناحية أخرى ما أدى إلى سقوط أكثر من 40 مصابًا، واعتقلت قوات الشرطة الطلاب بشكل عشوائي من ساحة كلية الصيدلة وفي جامعة الزقازيق 11 نوفمبر اعتدى الأمن الإداري لجامعة الزقازيق وبلطجية على مسيرة لحركة "طلاب ضد الانقلاب" وأطلقوا عليها الألعاب النارية والحجارة كما داهمت قوات من الشرطة، فجر يوم الأربعاء الموافق 13 نوفمبر، منازل بعض من الطلاب الأعضاء في حركة "طلاب ضد الانقلاب" بجامعة الزقازيق، وألقت القبض عليهم، على خلفية مشاركتهم في فعاليات احتجاجية بالجامعة. وفي 13 نوفمبر، اقتحم مجهولون كلية الحقوق وهاجموا بعض الطلاب المنتميين لحركة "طلاب ضد الانقلاب"، واعتدوا على طالبتين بالكلية، وتم نقلهم إلى المستشفى، وقاموا بتكسير بعض القاعات. كما رصد التقرير قيام قوات الأمن بجامعة أسيوط في 11 نوفمبر بإطلاق القنابل الغاز المسيل للدموع داخل الجامعة، لمنع مسيرة لحركة "طلاب ضد الانقلاب" من الخروج إلى الشارع. وحول الانتهاكات الإدارية (تحقيقات ومجالس تأديب) قال التقرير: أصدرت جامعة الزقازيق قرارا بفصل كل من رئيس اتحاد كلية الآداب ونائبه أسبوعين عن الدراسة بدعوى وصفهم لأحداث 30 يونيو بالانقلاب وقرار بفصل رئيس اتحاد طلاب كلية تكنولوجيا وتنمية، لمدة شهر بعد مشاركته بسلاسل بشرية أمام مبنى الكلية، للمطالبة بالإفراج عن الطلاب المعتقلين وفي جامعة الأزهر قرر مجلس تأديب بكلية التجارة فصل كل من رئيس اتحاد طلاب كلية التجارة، أسامة زيد، ونائبه معاذ زكريا، لمدة شهر بدعوى التحريض على العنف.