يعطي مجمع البحوث الإسلامية، للطلبة والطالبات الوافدين للدراسة بالأزهر، أهمية بالغة إذ ينظر لهم بحسب الدكتور محيي الدين عفيفي الأمين العام لمجمع البحوث الإسلامية، كونهم سفراء للأزهر الشريف في بلدانهم، لذا فقد أعد لهم خطة شاملة للتدريب والتأهيل للرد علي شبهات الجماعات الإرهابية والمتطرفة. وخلال عام 2018، عقد مجمع البحوث الإسلامية للطلاب الوافدين والطالبات الوافدات بمدن البعوث الإسلامية، 61 محاضرة ضمن الدورة العلمية الأولى للطلاب الوافدين في اللغة العربية، والثقافة الإسلامية، والرد على الشبهات التي تروجها الجماعات المتطرفة للتحذير منها، حاضر فيها أساتذة متخصصون -أيضا- من جامعة الأزهر. كما عقد المجمع 14 ورشة عمل للطلاب الوافدين تحت عنوان: "كيف تحاور متطرفا؟"، استهدفت كيفية التعامل مع الأفكار والآراء المنحرفة والشاذة التي تروجها الجماعات المتطرفة. في سياق متصل، عقد مجمع البحوث نحو 455 محاضرة خلال المراجعات العلمية التي نظمها للطلاب الوافدين والطالبات الوافدات بمدن البعوث الإسلامية، ضمن الأنشطة العلمية والثقافية التي يقدمها لهم خلال المرحلة الدراسية وأثناء الإجازات لحمايتهم من أية محاولات لاستقطابهم، ولمساعدتهم في الاستفادة الكاملة من المناهج الدراسية الرصينة للأزهر الشريف التي تشكل العقلية العلمية لهم. شملت تلك المراجعات محاضرات للطلاب الوافدين والطالبات الوافدات بجميع أقسام كليات أصول الدين واللغة العربية والشريعة والقانون والدراسات الإسلامية، حيث أجريت مراجعات للمواد والمقررات المختلفة لكل قسم، شارك فيها أساتذة تلك المواد من كليات جامعة الأزهر، لشرح بعض النقاط التي لم يتمكن الطلاب من فهمها أثناء المحاضرات في الكليات، وذلك تيسيرًا على الطلاب قبل دخول الامتحانات في هذه المواد الدراسية ودعما لمستوياتهم العلمية، وحثهم على التفوق والتميز الدراسي، حتى يكونوا سفراء متميزين للأزهر الشريف.