برغم أن الأسماك من أفضل الأطعمة الصحية للإنسان, وينصح بها الأطباء لمرضي القلب وانسداد الشرايين لخلوها من الدهون المشبعة والكوليسترول واحتوائها علي الكالسيوم والفوسفور واليود بكميات وفيرة. إلا أن الدراسات العلمية كشفت مؤخرا عن أن نسبة كبيرة من إنتاج مصر من الأسماك ملوث, وذلك علي حد تعبير الدكتور مجدي توفيق خليل استاذ البيئة المائية والتلوث بعلوم عين شمس, الذي يؤكد أن نحو65% من انتاج مصر الان من الاستزراع السمكي, الذي يحكمه للاسف قانون جائر من وزارة الري بعدم استخدام المياه النظيفة في الاستزراع و استخدام مياه الصرف بجميع أنواعه. وكشفت دراسة حديثة أشرف عليها الدكتور مجدي توفيق حول تلوث بحيرة المنزلة وتأثيره في الأسماك, عن أن مدينتي المنزلة والمطرية من أكثر مناطق الجمهورية إصابة بأمراض الكبد, حيث احتلت المنزلة المركز الأول في الإصابة بأمراض الكبد فقد بلغت نسبة الحالات المصابة51.76% من العينة العشوائية التي اعتمدت عليها الدراسة, أما المطرية فقد احتلت المرتبة الاولي في التسمم الغذائي حيث رصدت النتائج إصابة54.06% من عينة الدراسة. وأظهرت نتائج الدراسة انتشار الأمراض الكبدية والمعوية بين صيادي البحيرة الي ما وصفه بالكارثة الكبري التي تكمن في استخدام مياه مصرف بحر البقر غير المعالج الذي يأتي بمياه مجاري القاهرة الكبري الي جنوب بحيرة المنزلة والذي يستخدم للاسف في تغذية المزارع السمكية علي ضفاف هذا المصرف الذي يصل الي أكثر من120 كم, ويؤكد أن جميع أسماك البلطي المنتج منها ملوث تماما خاصة بالمعادن الثقيلة, وهو يوزع في جميع أنحاء الجمهورية. وتقول الدكتورة كوهار جارو أستاذ علم الحيوان بعلوم القاهرة ان الأبحاث التي أجريت علي بعض عينات من الأسماك أوضحت من خلال الفحص المجهري أن90% منها مصابة بيرقات الكونتراسيكم وتتركز الديدان في التجويف الخيشومي, وبالأخص في الجيب الوردي للأسماك, والذي ينفجر في معظم الأحوال نتيجة الإصابة بهذه اليرقات الدودية كبيرة الحجم والتي تؤدي الي موت عدد كبير من هذه الأسماك. ويؤكد الدكتور شعبان تهامي اخصائي الأمراض الباطنية والكبد أن المعادن الثقيلة مثل الزئبق والرصاص والزنك لها تأثير شديد السمية ولديها القدرة علي التراكم في أنسجة الحيوان والنبات لذا تعتبر النباتات التي تروي بمياه الصرف الصحي غير المعالجة ضارة للإنسان والنبات كما أن بعض الملوثات العضوية والكيميائية تسبب الإصابة بالأورام والفشل الكلوي للأفراد نتيجة استهلاكهم الأسماك المصيدة من المجاري المائية الملوثة بمياه الصرف الصحي والصناعي, وكذلك نتيجة تناولهم الخضراوات والفواكه المسمدة بمخلفات الصرف الصحي غير المعالج كما يحدث في كثير من الأماكن.