بعد انتهاء عملية التصويت بمحافظة مطروح، تم نقل الصناديق من مقرات الاقتراع إلى مقر لجنة الفرز بالقرية الأوليمبية بالكيلو 10 شرق مرسى مطروح، تحت حراسة قوات الجيش والشرطة، بعد تشميع الصناديق بواسطة القضاة وختمها بخاتم اللجنة. كما تم نقل صناديق اقتراع مركز سيوة والعلمين والحمام على متن طائرتين عسكريتين، الأولى نقلت الصناديق من القاعدة الجوية بسيوة إلى مطار مرسى مطروح، والثانية نقلت صناديق الحمام والعلمين والضبعة ونقلها على مرحلتين من مطار العلمين الدولى إلى مطار مرسى مطروح ومنه لجنة الفرز بالقرية الأولمبية التابعة للقوات المسلحة، وقد استقل الطائرة رؤساء اللجان الفرعية من القضاة وعدد من الموظفين من كل لجنة لمرافقة الصناديق.