كلف مكتب ارشاد جماعة الإخوان المسلمين الدكتور عبد الرحمن البر مفتي الجماعة بكتابة مقالة حول وثيقة الأزهر مع التأصيل الشرعي لها علي ان يتم عرضها علي مكتب الإرشاد قبل النشر. وطالب محضر اجتماع مجلس شوري الجماعة الأخير والذي اطلعت «روزاليوسف» علي نسخة منه وحمل عنوان "مطلوب من المكاتب والأقسام" خطباء الجماعة بالتحدث والإشادة بوثيقة الأزهر علي ان يتم الاستشهاد بها و بكتب حسن البنا مؤسس الجماعة وبكتابات الدكتور يوسف القرضاوي، كما طالب شوري الجماعة بتشكيل لجنة من أساتذة الأزهر وشبابه لدعم دور الأزهر. وقد جاء بند نص التكليف رقم 7 في محضر الاجتماع وحمل عنوانا فرعيا "مقترح بشأن وثيقة الأزهر ومستقبل مصر " وقال ما يلي " موقف المكتب من دعم الأزهر جامعا وجامعة ...تكليف د. عبد الرحمن البر بكتابة مقال حول الوثيقة مع التأصيل الشرعي لها وعرضها علي المكتب قبل النشر...تشكيل لجنة من د.عبد الرحمن البر ومجموعة من الأساتذة وشباب الأزهر وذلك لدراسة كيفية تقوية الدعم لدور الأزهر .... تكليف المكاتب الإدارية لدعوة الدعاة والخطباء بتناول موضوعات الوثيقة في خطبهم والاستشهاد بوثيقة الأزهر وكتب الإمام البنا وكتاب القرضاوي" ثم ختم البند بالعبارة التالية "ومطلوب تقرير من المكاتب". من جانبه قال البر لروزاليوسف إن الجماعة تؤيد وثيقة الأزهر مشيرا الي ان الجماعة قد أعلنت في رسالتها الأسبوعية التي تلت الوثيقة تأييدها لها، وحول دعوة الوثيقة للدولة الديمقراطية الوطنية وهو ما يتعارض مع دعوة الاخوان لدولة الخلافة قال البر "ليس هناك تناقضا في ذلك الإخوان مع الدولة الوطنية " وأضاف نحن نؤمن بثلاث دوائر للانتماء متكاملة وليست متناقضة وهي الوطنية والقومية والدائرة الإسلامية ". وعن دعوة الإخوان لأستاذية العالم التي تعني أن الجماعة توجهها ليس وطني او قطري قال البر" أستاذية العالم رؤية فكرية لقيادة العالم وليست سياسية". وأوضح البر أن الجماعة تؤمن بوجود كيان موحد يجمع الأمة العربية والإسلامية ايا كان مسماه لأن الأسماء لا يتعبد بها علي حد قوله، وعند سؤاله عن مدي قبوله بأن يحكم مصر ماليزي او اندونيسي قال البر دو هذا سؤال مغلوط من الأساس لأنه لا يمكن ان يحكم مصر ماليزي او يحكم ماليزيا مصري لكن عند قيام كيان عربي او إسلامي متكامل من حق أي فرد في هذا الكيان ان يترشح لقيادة الكيان وفي هذه الحالة الكيان ليس مصر حتي نقول سيحكم مصر ماليزي" وضرب البر مثالا لذلك بمجلس التعاون الخليجي قائلا " هل عندما يتولي رئاسة المجلس قطري او سعودي يقال إن الخليج يحكمه قطري او سعودي". واكد مفتي الجماعة ان كل المصريين يتمنون ان يروا مصر في يوم من الأيام ضمن كيان عربي واسلامي جامع وليس الاخوان فقط كاشفا ان الجماعة تؤمن اصلا بتكتل العالم في كيانات كبري، واعتبر البر من يرفضون انضمام مصر الي كيان إسلامي مخطئون ويجب ان توضح لهم مزايا ذلك.