نفى الدكتور محمد مختار جمعة وزير الأوقاف ما نشرته بعض المواقع الإخبارية حول وجود خلافات مع شيخ الازهر . وقال وزير الأوقاف في بيان له إن الإمام الأكبر الدكتور احمد الطيب شيخ الازهر صاحب فضل كبير في دعم وزارة الأوقاف وأئمتها وسائر أعمالها ، مضيفاً أنه في مقام الوالد والأستاذ ، فضلاً عن كونه قيمة وقامة علمية ووطنية وشيخًا لأزهرنا الشريف . وأوضح أن كل ما يتصل بعمل وزارة الأوقاف يقوم به وزيرها بمباركة ومساندة من الإمام الأكبر دون أي تدخل في آليات العمل ، مضيفاً أن الأوقاف لا تتدخل في أي شأن من شئون الأزهر ، وإنما هو سلطة ومسئولية إمامه ومؤسساته ، مشيراً إلى أن دوره باعتباره عضوًا بالمكتب الفني لشيخ الأزهر لشئون الدعوة قائمًا في عمل القوافل الدعوية المشتركة بين الأزهر والأوقاف برعاية الإمام الأكبر وإشرافي . وكانت قد نشرت بعض المواقع الإخبارية خبراً بان هناك توتر في العلاقة بين شيخ الازهر و الدكتور محمد مختار جمعه وزير الأوقاف .