أوقعت قرعة دور ربع نهائي بطولة الكونفدرالية الإفريقية، فريق المصري في مواجهة عربية قوية أمام اتحاد العاصمة الجزائري. وكان المصري تأهل للدور ربع النهائي، بعدما احتل المركز الثاني في مجموعته بدور ال16. ويواجه الفائز من مباراتي المصري واتحاد العاصمة الجزائري، يواجه الفائز من مباراتي فيتا كلوب الكونغولي ونهضة بركان المغربي. وتأهل المصري لهذا الدور بعد احتلاله المركز الثاني في مجموعته خلف نهضة بركان المغربي. وشارك المصري في ثلاث مسابقات أفريقية ، قبل التواجد في نسخه هذا العام بالكونفدرالية، واجه خلالها عددا من الفرق العربية نرصد نتائجه معها في هذا التقرير. تخطي المريخ في عام 1999 دون فريق المصري مشاركته الأولى بالبطولات الأفريقية، خلال بطولة كأس أفريقيا للأندية أبطال الكؤوس، حين كان بطلا لكأس مصر. في تلك النسخه وصل المصري إلى الدور نصف النهائي، اصطدم بفريق عربي وهو المريخ السوداني وتخطاه في دور ال 32 بركلات الترجيح، بعدما انتهت مواجهتي الذهاب والإياب بنفس النتيجة. واصل الفريق البورسعيدي مشواره في تلك النسخة وخرج من الدور قبل النهائي على يد الأفريقي التونسي ، بعد الخسارة في ملعب بورسعيد برباعية. عقبة جزائرية بعد ثلاث أعوام من إنجاز 1999، كرر نادي المصري هذا الإنجاز والتأهل للدور قبل النهائي في عام 2002، وكان الوداع في تلك النسخة على يد فريق شبيبة القبائل الجزائري، عقب الفوز في بورسعيد بهدف دون رد وبعدها الخسارة في الجزائر بهدفين دون رد. الظهور الأخير في ظهوره الأخير بالبطولات الأفريقية، لم يكتب لفريق المصري تحقيق انجاز يذكر، بعد الخروج من دور ال 32 بالكونفدرالية أمام كمبالا سيتي الأوغندي بركلات الترجيح، حيث انتهت مواجهتي الذهاب بنفس النتيجة وهي فوز كل فريق على ملعبه بهدف دون رد.
