أجرى الاتحاد المصري لكرة القدم قرعة الدوري الممتاز المصري لموسم 2012/ 2013 مرة أخرى، بعد القرار الذي إتخذه بإقامة المسابقة على مجموعتين . وذكر مراسل korabia.com أن الأهلي سيكون على رأس إحدى المجموعتين، والتي ستضم أندية الإسكندرية، بينما سيكون الزمالك على رأس المجموعة الثانية التي سيكون من ضمن فرقها أندية القناة، وذلك تفادياً للمشاكل الجماهيرية بين جماهير تلك الأندية والأهلي. وضمت المجموعة الأولى أندية الأهلي وإنبي وحرس الحدود وسموحة ومصر المقاصة والجونة ووادي دجلة وغزل المحلة وتليفونات بني سويف. على الجانب الآخر، ضمت المجموعة الثانية كل من الزمالك والإسماعيلي واتحاد الشرطة والإنتاج الحربي والاتحاد السكندري وبتروجيت وطلائع الجيش والداخلية والمقاولون. أما عن التتويج فسيحسم اتحاد الكرة موقفه من تلك المسألة غداً، حيث سيتم الاختيار بين طريقتين إحداهما تقضي بتأهل الأول والثاني من كل مجموعة للدور النهائي للعب بنظام الدوري وتحديد البطل - الذي يجمع أكبر عدد من النقاط - أما الثانية فتشمل صعود الأول والثاني من كل مجموعة لإقامة مباراتين على طريقة "المقص" يخوض الفائز في كل منهما اللقاء النهائي على اللقب. أما الفرق الهابطة فتتحدد عبر لعب دوري بين الفرق الثلاثة الأخيرة من كل مجموعة، ليهبط أربعة فرق، ويبقى الباقي في الممتاز.