نفى مجلس شورى العلماء، ما تردد عن دعمه للدكتور محمد مرسي فى انتخابات رئاسة الجمهورية، حيث كتب الشيخ أبو بكر الحنبلي الداعية السلفي وأحد أعضاء "شورى العلماء" على حسابه الخاص على موقع فيس بوك، إن المجلس لم يستقر بعد على اختيار دعم أى من المرشحين، معبرا فى الوقت نفسه عن احترام المجلس وعلمائه للدكتور مرسى وجماعة الإخوان المسلمين. ومن المنتظر أن يعلن المجلس اسم مرشحه المفضل فى السباق الرئاسى يوم الأربعاء المقبل، حسب بيان المجلس اليوم، الذى شدد على أنه لم يصدر عن مجلس شورى العلماء ما يفيد دعمه أى من المرشحين على الساحة، مطالبا الجميع بتحري الصدق، وقد صرح مصدر مطلع فى مجلس شورى العلماء بأن هناك اتجاه كبير لدى شيوخ المجلس، لدعم مرسي بالفعل، ورفضهم القاطع لأى مرشح لا يتضمن برنامجه الانتخابى تطبيق الشريعة الإسلامية بشكل صريح. وقال المصدر نفسه، إن اثنين من مشايخ المجلس مصرين على رفضهم تأييد أي من المرشحين المطروحين على الساحة، أحدهما الشيخ أبو إسحاق الحويني. يذكر أن مجلس شورى العلماء قد تأسس بعد ثورة يناير، ويضم فى عضويته الدكتور عبد الله شاكر رئيس جماعة أنصار السنة، والدعاة محمد حسان وأبو اسحاق الحويني ومحمد حسين يعقوب وسعيد عبد العظيم ومصطفى العدوي وجمال المراكبي ووحيد بالي وابو بكر الحنبلي وجمال عبد الرحمن.