أكد الدكتور أحمد عاصم الملا إستشارى الحقن المجهرى والمناظير النسائية أن هناك العديد من الأسباب التي تقود إلى فشل الحقن المجهري، منها ما هو مجهول السبب ومنها عائد إلى البيئة المحيطة بالعملية ومنها ما هو عائد إلى إهمال الأم بعد العملية. وقال أن أهم الأسباب التي تؤدى الى فشل الحقن المجهري عمر السيدة فكلما كانت الأم بعمر أصغر كانت احتمالية نجاح الحقن المجهري أكبر، فالنساء في عمر أكبر من 41 يسعين أحيانًا للحصول على بويضات من إناث أكثر شبابا لزيادة الفرصة و أن حالة الجنين ضمن الأنبوب تلعب دورا كبيرا في نجاح عملية الحقن فالأجنة الأقل نموا تحمل خطر فشل الحقن المجهري بشكل أكبر من الأجنة الأكثر نموا بعمر يومين إلى ثلاثة أيام ضمن الأنبوب. وأشار الدكتور أحمد عاصم الملا أن بعض العوامل المتعلقة بنمط الحياة أحيانا تؤدى الى فشل الحقن المجهرى حيث يؤدي التدخين إلى إنقاص نسبة نجاح الحقن المجهري إلى ما يقارب النصف كما ترفع البدانة وتناول الكحول والمخدرات وشرب القهوة بشكل مفرط وبعض الأدوية من نسبة فشل الحقن المجهري.