شارك عدد كبير من القيادات الكنائس المصرية في الانتخابات وحثت الأقباط على التصويت. ومن جانبه أكد الأنبا باخوميوس قائم مقام البطريرك أنه أدلى بصوته في الانتخابات الرئاسية بمدينة دمنهور بالبحيرة مشيرا إلى أن الكنيسة تقف على الحياد من كل المرشحين ، وأشار الى ان الكنيسة تؤمن بالديمقراطية مؤكدا انها تعطى الحرية لكل ابنائها فى اختيار من يريدونه، منوها بأن الكنيسة لا تحجر على أحد. وقال القمص إنجيلوس ، سكرتير الانبا باخوميوس" فليشارك الاقباط فى العملية الانتخابية كواجب وطنى وديني " مؤكدا ان الانبا باخوميوس حريص على المشاركة فى كل الانتخابات ،وأضاف ان الكنائس تصلى من اجل مرور الانتخابات بسلام وياتى ممثل للشعب المصري قادر على انتشال مصر من اوضاعها الراهنة. فيما شارك الانبا يوأنس الأسقف العام فى الانتخابات بمدرسة الشهيد عماد على كامل بشارع احمد سعيد مؤكدا أن الانتخابات تجربة ديمقراطية رائدة يجب أن يشارك فيها كل المصريين ، حتى يؤكدوا للعالم عظمة الشعب المصري وتمنى أن تمر الانتخابات بسلام والحفاظ على ارواح المصريين".