دخلت قوات الأمن، فى الساعات الأولى من صباح اليوم الخميس، المدينة الجامعية لجامعة الأزهر، بعد الحصول على إذن النيابة وموافقة رئيس الجامعة، وذلك لضبط العناصر المثيرة للشغب من الطلاب داخل المدينة. وقام طلاب الإخوان بجامعة الأزهر برشق الشرطة بالحجارة وزجاجات المولوتوف من داخل المدينة الجامعية ورد الأمن عليهم بقنابل الغاز.
فيما أشعل طلاب الإخوان النار فى الأشجار داخل المدينة الجامعية، ودخلت قوات الأمن المدينة لإتاحة الفرصة لسيارات الإطفاء للدخول.