فى أول أيام جولة الإعادة بإنتخابات الرئاسة بمحافظة الأقصر ، تم رصد عدد من التجاوزات والإنتهاكات وكان منها قيام أنصار الدكتور "محمد مرسى" مرشح رئاسة الجمهورية بخرق الصمت الإنتخابى ، وذلك بقيامهم بإستخدام أجهزة اللاب توب أمام لجنة مدرسة التعليم الأساسى بمدينة الزينية قبلى بالأقصر ، لتوجيه الناخبين للتصويت لمرشح حزب الحرية والعدالة.
مما دعا أنصار الفريق "أحمد شفيق" لإبلاغ رئيس اللجنة بهذا التجاوز لإتخاذ الإجراء اللازم. كما تأخر فتح بعض اللجان الإنتخابية بمحافظة الأقصر لتأخر وصول القضاة لمدة نصف ساعة ، مما أثار استياء الناخبين ، ومن اللجان التى تأخر فتحها لجنة مدرسة سيدى أحمد بن إدريس بإسنا ، ولجنة مدرسة الشهيد جابر محمد إبراهيم بقرية الحلة بإسنا ، ولجنة مدرسة صلاح الدين الإبتدائية المشتركة بالأقصر ، ولجنة مدرسة سيدى أبو الحجاج الإبتدائية بالأقصر ، ولجنة مدرسة الجهينات الإعدادية بإسنا.
وفى السياق نفسه ، شهد مركز أرمنت جنوبالأقصر تأخر فتح لجنة 29 بالمعهد الثانوى بنين لمدة ساعة ونصف ، ولجنة 23 ، 24 بمركز شباب أرمنت الحيط لمدة نصف ساعة.
ومن ناحية أخرى ، شهدت لجنة 16 بمدرسة القرنة غرب الأقصر وقوع اشتباكات بين مؤيدى الدكتور "محمد مرسى" والفريق "أحمد شفيق" ، حيث قام المدعو "محمد الدكر" رئيس مركز شباب الرواجح بالقرنة – من أنصار "شفيق" بتوجيه الإتهامات للمدعو "محمد أحمد عمر قناوى" أحد أقطاب الإخوان المسلمين بالقرنة ، بتوزيع زجاجات الزيت والسكر ، ورد الأخير بإتهامه بتوزيع أموال لصالح "شفيق" ، مما أسفر عن اشتباكات بين مؤيدى المرشحين أمام اللجنة ، وقام كبار عائلات القرنة بفض النزاع.
ووقعت اشتباكات بين مؤيدى مرشحى الرئاسة بلجنة مركز شباب أرمنت ، مما أدى إلى تدخل قوات الشرطة العسكرية لفض النزاع وغلق اللجنة الإنتخابية لمدة نصف ساعة وفتحها بعد أن هدأت الأوضاع.
كما رفض المدعو "محمد حسن محمد حماد" عقب قيامه بالتصويت بلجنة مدرسة كومير الإعدادية بقرية النمسا بإسنا جنوبالأقصر ، وضع إصبعه داخل الحبر الفسفورى.
وقام المستشار "أحمد محمد محمود" رئيس اللجنة بعمل محضر للناخب ، وإبلاغ اللجنة الفرعية. وفى السياق نفسه ، رفضت إحدى السيدات المنقبات بعد إدلائها بصوتها بلجنة مدرسة الإعدادية بنات ، أن تضع إصبعها داخل الحبر الفسفورى ، فقام رئيس اللجنة بسحب بطاقتها الشخصية. ومن جانبهم ، رفضت السيدات الناخبات بلجنة وحدة صحة المرأة بالعضايمة "4" بمدينة إسنا جنوبالأقصر ، استخدام الأقلام الموجودة باللجنة للتصويت ، وذلك عقب انتشار إشاعة وجود أقلام حبر متطاير ، مما جعل الناخبات يصرون على إستخدام أقلامهم. وعلى الفور ، اتصل المستشار "وليد محمد محمود" مستشار اللجنة برئيس اللجنة الفرعية للإنتخابات بإسنا ، وبناء عليه انتقلت اللجنة برئاسة المستشار "أبو الحسن محمد بهاء الدين" وقام إحتواء الموقف وإقناع الأهالى أن هذه مجرد شائعات. ومن ناحية أخرى ، قامت المدعوة "هالة.م" بتصوير بطاقة الإقتراع الخاصة بها بعد إدلائها بصوتها لصالح "مرسى" ، وتمكن مستشار لجنة مدرسة الكرنك الإبتدائية من ضبطها ، وحرر محضر بذلك وتم التحفظ عليها بمركز شرطة الأقصر.