صممت الأكاديمية الوطنية للتدريب برنامجا تدريبيا مكثفا للنواب الجدد للمحافظين، وذلك بناء على تكليف من رئيس الجمهورية بتدريب كافة العاملين في الجهاز الإداري للدولة. ويأتي ذلك في إطار سعي الدولة المصرية لتأهيل العاملين بها بشكل عام ورفع كفاءة العاملين وتدريبهم بهدف تحسين أداء الخدمات المقدمة للمواطنين. ويتضمن برنامج تدريب نواب المحافظين الجدد مهارات القيادة الفعالة ومهارات التواصل الفعال ومهارات الذكاء العاطفي والاجتماعي والمهارات الإدارية كإدارة الوقت وإدارة الأزمات وإدارة المشروعات وإدارة فرق العمل الناجحة وإدارة وقيادة التغيير والقانون والتعريف بمبادئ الاتيكيت والعلاقات العامة والتعامل مع الجمهور.