أصدر الدكتور محمد مرسى رئيس الجمهورية القرار الجمهورى رقم327 لسنة 2012 بنقل تبعية مستشفى أسوان التعليمى إلى مستشفى أسوان الجامعى. وتتضمن القرار ان يكون المستشفى مقراً نظرياً لكلية الطب للاستفادة بكل إمكانياتها ، سواء كانت مباني أو أجهزة طبية أو كوادر بشرية ، وذلك من أجل رفع مستوي الخدمة الطبية في أسوان وجنوب الصعيد وتشجيعاً للسياحة العلاجية من أفريقيا خاصة والعالم العربي والدولي بشكل عام. جدير بالذكر انه كان مخططا إنشاء ملحق بالمستشفي للإصابات والطوارئ علي مساحة 3 الاف متر مربع يضم 150 سريرًا وذلك لتغطية جميع التخصصات الطبية اللازمة والتي تصل لأكثر من 20 تخصصًا .