قالت داليا زيادة، المدير التنفيذى السابق لمركز ابن خلدون، "كنت أفكر في الاستقالة من المركز منذ فترة طويلة ولكن كنت أنتظر التغيرات في سياسة المركز المعادية للسياسة المصرية بما يسيء إلى دولتنا وكنت دائمة الاعتراض علي التوجهات الخاطئة". وأضافت زيادة، خلال حوارها مع الإعلامي أحمد موسى، في برنامج"علي مسئوليتي" المذاع علي فضائية"صدى البلد"، "ان النقطة الفارقة والتي حددت استقالتي المقالة التي كتبها الدكتور سعد الدين إبراهيم، مدير المركز، ضد القيادة السياسية وإباحة للتمويل الأجنبي بالاضافة الي انتقاده الشخصي لأعضاء المركز بإظهار جماعة الإخوان كجماعة إرهابية في جينيف وهذا ما أدى لوصول الخلاف إلي ذروته". وأوضحت أن سعد الدين ابراهيم لم ير جماعة الاخوان علي أنها ارهابية ويدعو دائما الي التصالح معهم وإدراجهم ضمن الاحزاب السياسية.